RS Bethesda diresmikan oleh Dr. J. Gerrit Scheurer dengan nama PETRONELLA ZIENKENHUIS dan berdiri sejak tanggal 20 Mei 1899. Rumah sakit ini telah memberikan dampak yang besar bagi masyarakat sekitar Yogyakarta. Hal ini terbukti dari nama yang dulu diberikan oleh masyarakat sekitar, yaitu RS TOELOENG/PITULUNGAN karena dalam memberikan pelayanannya kepada pasien, rumah sakit ini tidak memandang apa dan siapa pasien itu, tetapi mengutamakan pertolongan lebih dahulu ("Tolong dulu, urusan belakang"). Setelah berganti nama menjadi YOGYAKARTA TJUO BJOIN dan kemudian diganti lagi menjadi RUMAH SAKIT PUSAT, akhirnya diputuskan nama yang lebih tepat, yaitu Rumah Sakit Bethesda (Kolam Penyembuhan). Alasan penggantian nama yang terakhir ini berhubungan erat dengan misinya bahwa rumah sakit ini adalah rumah sakit Kristen yang memberikan pelayanan kasih sesuai dengan yang diajarkan oleh Kristus. Jika Anda ingin tahu lebih jauh tentang layanan rumah sakit ini, silakan berkunjung ke alamat situs di atas.